Este aşezat la picioarele munţii Harghitei în partea de sud. Clima orăşelului este muntoasă, adică mai aspră decât cea normală. Chiar şi zicala spune: „nouă luni sunt întotdeauna reci şi nici restul trei nu sunt calde.” Vântul din nord-est aduce secetă, în schimb iarna cauzează ger. Vântul din sud-vest este mai domol şi mai bogat în ploaie. Iarna sunt dese viscolele, respectiv aversele din vară, grindinele. La nord-vest se află satul Căpâlniţa, la sud-vest satul Lueta, la nord-est Siculeni iar la est se află Miercurea Ciuc. Vlăhiţa este parcurs de pârâul Homorod-Mic pe un traseu de şase kilometri şi care defineşte direcţia oraşului. Albia pârâului este artificial deoarece pe acest teritoriu apele freatice sunt la mari adâncimi. În prezent apa potabilă este rezolvată cu ajutorul unui bazin care se află în partea de nord al localităţii. Vegetaţia nu diferă de specificul zonelor învecinate. Aici se află minunata Poiană a Narciselor (Narcissus stellaris). În luna mai poiana se îmbracă în alb pentru că în această perioadă înfloresc narcisele. O altă floare rar întâlnită este Papucii Doamnei (Cypripedium calceolus). Pantele muntelui sunt acoperite cu fagi şi brazi. Pe teritoriul muntelui se găsesc nenumerate izvoare de ape minerale şi mofete. În păduri se află multe animale sălbatice, iar în apele muntoase sunt păstrăvi.
